1、酸洗：用5%的硝酸溶液浸泡8小時以上，溫度為40度。在超聲波清洗機中最佳。浸泡后用過濾去離子水或注射用水內外沖至中性，測導電率。用純凈空氣≥0.4Mpa壓強吹干。
2、堿洗：用3-5%的氫氧化納分析純溶液浸泡30-60分鐘，溫度40度左右。在超聲波清洗機中最佳。浸泡后用過濾去離子水或注射用水內外沖至中性，測導電率。用純凈空氣≥0.4Mpa壓強吹干。
注：以上兩種方法可以單獨使用，也可以相互配合交替使用。如有條件，可以結合超聲波清洗機效果最佳。
3、有機物污染可結合表面活性劑清洗，細胞碎片污染體系結合酶清洗效果更理想。
4、要經常在線反吹洗，（在線清洗用純凈的壓縮空氣或過濾原液或潔凈水反沖）可減少用以上方法清洗的次數。